工程结算审计包含以下内容：
审核竣工结算编制依据：
包括工程竣工报告、竣工图及竣工验收单、工程施工合同或施工协议书、施工图预算或招标投标工程的合同标价、设计交底及图纸会审记录资料、设计变更通知单及现场施工变更记录、经建设单位签证认可的施工技术组织措施、预算外各种施工签证或施工记录、合同中规定的定额、材料预算价格、构件、成品价格等。
审查各项费用的计取：
包括附属工程的审查，防止各种计算误差，以及审核施工企业资质，对挂靠、无资质等级及无取费证书的施工企业，应降低综合单价或审计确定综合单价及造价。
中间结算检查：
检查工程形象进度的工程量，施工产值和预算成本是否正确、真实，本期应结工程价款净值是否与本期实际完成的施工产值或结算价值相符，扣除预收工程款、抵扣备料款、甲方材料款以及其他应扣款后的余额相符。
竣工结算审查：
审查竣工质量验收、竣工决算的合规性，未完部分尾工预提费用的合理性以及双方经济往来是否清楚，有无违反结算纪律行为。
工程量审核：
依据竣工图、设计变更、计算规则等进行计算，全面核实项目工程量，防止重复计算或多算。
定额套用审核：
注意对应清单的项目特征与竣工图的描述是否一致，新增单价定额套用的审核需按合同约定的变更组价要求执行，定额套用中的人工费、材料费的确定要按合同约定执行。
材料设备单价审核：
审查材料设备价格是否符合实际价格，新增材料设备认质认价过程。
资料审核：
包括完整的施工图、竣工图，招标文件、招标答疑、补充文件，投标文件、施工合同和补充协议，图纸会审记录、施工组织设计、会议纪要，业主指定或自供的设备、材料型号、品牌，设计变更单、工程联系单及现场签证单，地基验槽记录、工程隐蔽记录、施工日志，桩基检测报告与验收记录等。
合同审核：
施工合同审核是工程结算审核的重要内容，审计人员需要对照施工合同中的条款，特别是关于工程价款结算方式、计价依据、风险分担等，确保结算符合合同约定。
通过这些内容的审计，可以确保工程结算的准确性、合规性和真实性，从而保障建设单位和施工单位的合法权益。