处理多开的发票有以下几种方法：
及时作废并重新开具
如果发票尚未跨月，企业应要求对方配合，及时收回所有发票联次，并在当月作废原发票，然后按照正确的金额重新开具发票。
开具红字发票冲销
若发票已经跨月且已抄税申报，企业不能直接作废发票，而应开具红字发票将原发票冲销，再按照正确金额重新开具发票。在开具红字发票时，企业必须严格遵守税务机关规定的操作流程，特别是增值税专用发票。
双方协商补正
发票开多了可以通过双方协商、签订补正协议或申请书等方式补正发票金额，确保发票款项不影响双方经营活动。确认发票形式后，双方需填写相关协议书或补正函，并签字确认，保留有效凭证。
向税务机关申请
如果双方无法达成一致或发票金额已影响购方正常经营，可以向当地税务机关或涉税机构提出异议，由相关部门对发票金额进行核实，并出具申请书。
电子发票的处理
对于电子发票，可以通过查询发票后台将原有金额多开的电子发票作废，并重新开具新的电子发票以补正。
客户退还发票
如果客户愿意将多开的发票退还，可以直接将这张发票冲红。若客户不退还，可以等待发票遗失后去税务局办理发票遗失手续，并将该发票冲红。
与开票方沟通
及时与开票方联系，要求其纠正错误，并开具正确金额的发票。若开票方拒绝合作或存在违法行为，可以向税务机关举报，并提供相关证据，依法追究其责任。
按照实际支付金额入账
核实发票金额与实际支付金额的一致性，若发票金额大于实际支付金额，则按实际支付金额入账；若发票金额小于实际支付金额，则补齐实际支付的发票数额后方可入账。
建议
及时沟通：发现多开发票后，应尽快与对方沟通，确保问题得到及时解决。
遵守流程：在处理多开发票时，务必遵守税务机关的相关规定和流程，避免因操作不当引发更大的税务风险。
保留证据：在处理过程中，应妥善保存所有相关协议、补正函、申请书等书面证据，以备不时之需。