父亲将房子过户给儿子需要缴纳的费用主要包括以下几项：
契税：
根据房屋评估价格的3%来计算，但具体税率可能因地区和房屋情况有所不同。有些情况下可能会有优惠政策，比如子女将房产再次出售时，可能会享受较低的税率。
个人所得税：
如果是通过赠与方式过户，受赠人（儿子）需要缴纳个人所得税，通常是房屋评估价格的1%或房屋原价的20%。但若房屋持有时间超过一定年限且为家庭唯一住房，可能会有免税政策。
印花税：
一般为房屋评估价格的0.05%。
土地增值税：
根据房屋持有时间和增值额的不同，税率可能为房屋评估价格的1%或房屋原价的30%。
其他费用：
包括登记费、核档费、评估费、公证费和手续费等。这些费用的具体金额因地区和具体情况而异，但一般不会很高。
具体费用示例
以一套市场价值为120万元的房屋为例，如果通过赠与方式过户：
契税：36,000元（120万 × 3%）
公证费：2,400元（120万 × 2%）
登记费：80元
印花税：600元（120万 × 0.05%）
其他费用：可能包括几百元的手续费等
总计：约40,080元
如果通过买卖方式过户，且房屋满五年且为唯一住房：
契税：根据房屋面积和是否首次购房，契税率为1%或1.5%
个人所得税：免征
印花税：万分之五
营业税：免征
其他费用：几百元的手续费等
总计：根据具体房屋面积和是否首次购房，费用在1,200元至3,600元之间。
建议
选择合适的过户方式：赠与和买卖是两种主要的过户方式，各有不同的税费政策。赠与适合短期内需要完成过户且希望节省费用的情况，而买卖适合长期持有且考虑未来出售的情况。
咨询当地房产部门：不同地区的税费政策可能有所不同，建议在办理过户前咨询当地房产管理部门或专业律师，了解最新的税费政策和具体费用。
通过以上信息，可以更全面地了解父亲将房子过户给儿子所需缴纳的费用，并根据自身情况选择最合适的过户方式。