运费税的计税额计算公式如下：
小规模纳税人
增值税应纳税额 = 运输服务不含税收入额 × 适用税率
适用税率为3%
一般纳税人
增值税应纳税额 = 当期销项税额 - 当期进项税额
进项税额计算公式：进项税额 = 运输费用金额 × 扣除率
适用税率为9%
例子
假设运费为10000元，企业为一般纳税人：
不含税收入 = 10000元 / （1 + 9%） = 10000元 / 1.09 ≈ 9174.31元
进项税额 = 10000元 × 9% = 900元
销项税额 = 不含税收入 × 9% = 9174.31元 × 9% ≈ 825.69元
增值税应纳税额 = 销项税额 - 进项税额 = 825.69元 - 900元 = -74.31元（可抵扣进项税额）
建议
一般纳税人：在计算进项税额时，务必注意运输费用金额和适用税率，以确保准确计算抵扣额。
小规模纳税人：直接使用不含税收入乘以3%的税率即可得出应纳税额。
希望这些公式和解释对你有所帮助。